对此，《日本经济新闻》10日2时30分左右报道，日本外务省10日凌晨发表谈话，称“申请‘入遗’是基于中国单方面的主张，本应中立公平的联合国教科文组织的这一行为存在问题，我们感到非常遗憾”。此前，日本政府也多次表示反对，要求中国撤回申报。
中国申报的南京大屠杀档案包括东京审判和南京军事法庭的记录、日本军人拍摄的与大屠杀相关的照片、美国传教士拍摄的影像等。在南京大屠杀问题上，中国一贯主张遇难者为30万人，但日本存在多种说法，认为遇难者从几万到20万不等，甚至有意见否认大屠杀这一事件本身，报道称目前日本方面尚无定论。9日，中国外交部发言人华春莹主持例行记者会。在回应“日方反对《南京大屠杀档案》申报世界记忆名录”问题时，华春莹表示，中方申报符合世界记忆名录标准，相信教科文组织将做出公正且经得起历史考验的结论。华春莹还说，日方有关言行再次表明了其不愿正视历史的错误态度。中方敦促日方本着对历史负责任的态度，正视和深刻反省侵略历史，妥善处理有关问题，以实际行动取信于亚洲邻国和国际社会。
